Podstata hodnotenia efektívnosti EMS spočíva vo výpočte výšky efektov (úspor, výnosov) podniku zo zavedenia EMS a v sumarizácii nárokov (nákladov) na ich dosiahnutie.
Ukazovatele efektívnosti a návratnosti kapitálu uloženého do zavedenia a udržiavania EMS.