Spokojnosť zamestnanca ako základný faktor ovplyvňujúci fluktuáciu sa nepochybne viaže k jeho motivácii. Dosiahnuť spokojnosť zamestnancov a udržiavať tak mieru fluktuácie na požadovanej úrovni, je teda úlohou, ktorá si nepochybne vyžaduje citlivosť manažmentu vzhľadom k motivácii ich podriadených. Hoci sa za hlavný motivačný činiteľ zamestnancov považujú vo väčšine stále peniaze, nesmieme opomenúť celý rad ďalších, veľmi dôležitých motivačných činiteľov. Ich význam narastá najme v prípade kedy sú primárne potreby zamestnancov dostatočne uspokojené a práca prestáva mať iba charakter zdroja obživy, bývania a pod. Je preto dôležité aby mala firma vypracovaný motivačný program, dostatočne flexibilný aby reflektoval individuálne motivačné charakteristiky zamestnancov a zároveň odzrkadľujúci firemnú kultúru a záujmy firmy.
Systém motivácie zamestnancov sa pritom podľa Urbana (4) opiera o dve základné nástroje a to pracovné prostredie a systém odmien. Z tohto pohľadu môžu kvality pracovného prostredia prispieť k zníženiu nákladov spojených s finančným ohodnotením zamestnancov, k týmto faktom Urban radí(4):