Likvidácia a bezpečné zneškodnenie rádioaktívnych odpadov (predovšetkým vysoko rádioaktívnych odpadov) predstavuje asi najhorší článok jadrovej energetiky. Problémom jadrového odpadu, je že rádioizotopy produkované jadrovými reaktormi sú aktívne desiatky, stovky, tisíce a niektoré dokonca až milióny rokov. Jadrová štiepna reakcia vyúsťuje do tvorby častíc, ktoré sú v biosfére neprirodzené a ktorým sa živé organizmy nedokážu a nemôžu prispôsobiť. Medzinárodná agentúra pre atómovú energiu odhaduje množstvo rádioaktívneho odpadu a vyhoretého jadrového paliva v polovici tohto storočia na 450 000 ton. V súčasnosti sa na svete nahromadilo približne 250 000 ton. Predovšetkým vysoko rádioaktívny odpad predstavuje najnebezpečnejší odpad, aký kedy človek vyprodukoval a už vyše 50 rokov nie je schopná jadrová energetika tento problém riešiť.
Tieto a mnohé iné riziká stavajú jadrovú energetiku do pozície, kedy nie je možné prevádzku, kontrolu, bezpečnosť a financovanie ponechať iba na jadrový priemysel. Je tu nutná nezávislá kontrola