Jednobunkový organizmus, dosahujúci iba mikroskopické rozmery, viditeľný svetelným mikroskopom.
/Pre metódy štúdia mikroorganizmov je spoločné a charakteristické, že na rozdiel od rastlín a živočíchov sa spravidla neštudujú vlastnosti jedného jedinca, ale vlastnosti celej populácie daného biologického druhu, najčastejšie klonu, ktorý vznikol z jednej bunky vegetatívnym množením./
Sú mikroorganizmy rastliny alebo živočíchy?
Od čias Aristotela sa delili živé organizmy na rastliny a živočíchy.
Po objavení mikroorganizmov vznikla otázka, kde ich zaradiť? Pôvodne zaradili baktérie a huby do rastlinnej ríše a prvoky do ríše živočíšnej.
V 19. storočí na návrh E.H. Haeckela rozdelili živý svet na tri ríše: rastliny, živočíchy a protisty (nižšie protisty – baktérie včítane riketsií a chlamýdií a vyššie protisty – prvoky a huby). Spoločným a definujúcim znakom ríše protist je, že sú to organizmy jednobunkové, pokiaľ sú viacbunkové, sú tvorené agregátmi rovnocenných buniek /nikdy netvoria pletivá!!!/
Podľa súčasných názorov založených na poznatkoch modernej biológie živé organizmy delíme na:
archeóny, baktérie a eukaryota.
Prvé dve línie – archeóny a baktérie - sú prokaryota alebo prokaryotické organizmy, lebo sú charakteristické prokaryotickým typom buniek (patria medzi mikroorganizmy).
Rastliny a živočíchy sú tvorené eukaryotickými bunkami, sú eukaryota.