Názov ekológia zaviedol nemecký zoológ Ernst Haeckel (1866). Vznikol z gréckeho oikos (obydlie, hospodárstvo a značí hospodárenie, ekonomiku prírody). V učebniciach ekológie považujeme podľa zákona priority za základnú Haeckelovú definíciu (1866) "Ekológia je veda o vzájomných vzťahoch medzi organizmami a ich anorganickom a organickom prostredí". Haeckel svoju pôvodnú definíciu pozmenil v roku 1979 "Ekológia je veda o ekonómii prírody".
Haeckel chcel povedať, že rastlinám, hmyzu, zvieratám a prostrediu, v ktorom žijú, sa nedá porozumieť, ak ich budeme skúmať oddelene. Jednotlivé vzťahy tvoria totiž jediný ucelený komplex. Ekológia však neznamenala viac než slovo, pokým za ním vedci v 20. storočí nezačali hľadať konkrétny význam.