Josef Charvát sa narodil v Prahe 6. augusta 1897. Vyštudoval lekársku fakultu Karlovej univerzity v Prahe. V rokoch 1939 – 1945 viedol univerzitnú polikliniku. Za koncepciu neurohumorálnych vzťahov mu bola udelená štátna cena Klementa Gottwalda. Niekoľko rokov pôsobil vo vedeckých poradenských zboroch Organizácie spojených národov v New Yourku a Svetovej zdravotníckej organizácii v Ženeve.