Somatický nervový systém (nervy kostrového svalstva, povrchových zmyslov, zmyslových orgánov) reaguje na podnety okolitého prostredia odpoveďou smerujúcou prevažne navonok (napr. obranný reflex). Mnohé aktivity somatisckého nervového systému sú pod voľnou kontrolou a prebiehajú vedome.
Naproti tomu autonómny (vegetatívny) nervový systém (ANS) zaisťuje riadenie funkcíí vnútorných orgánov, prispôsobuje ich aktuálnym potrebám a kontroluje vnútorné prostredie organizmu. Tieto činnosti sú z veľkej časti mimo oblasť voľnej kontroly, preto sa tento systém nazýva autonómny nervový systém.