Železničná doprava kapacitou svojich dopravných prostriedkov zabezpečuje najväčší podiel prepravy tovaru a veľký podiel požiadaviek na prepravu osôb. Od 1. januára 2005 zabezpečujú služby zákazníkom v železničnej doprave na území Slovenskej republiky tri organizácie: o Železnice Slovenskej republiky o Železničná spoločnosť Cargo Slovakia o Železničná spoločnosť Slovakia
Na území Slovenska sa nachádzajú železničné trate zaradené do medzinárodných železničných magistrál AGC, ktoré nevyhovujú európskym parametrom a nedostatočné je aj medzinárodné železničné prepojenie, menovite do Rakúska a Poľska. Celkový počet železničných staníc a zastávok je 868, z toho 20 prechodových.. Na železničnú sieť nie je pripojený okres Svidník a Námestovo. Okres Veľký Krtíš je napojený železničnou traťou vedúcou cez územie susedného Maďarska.