Embryonálna a fetálna mortalita je dôležitým zdrojom zlyhania žrebnosti kobýl. Odhady percenta mortality medzi10 a 45 dnom gravidity sú medzi 5-30%. Fetálna mortalita(FM) alebo zlyhanie žrebnosti po dni 45-60 je menšia než embryonálna mortalita (EM); avšak niektoré z tých istých faktorov vyvolávajúcich EM môže prispiet k FM. Za mortalitu zodpovedajú: odchýlka v prostredí maternice, vajcovodu; endokrinné odchýlky; vek kobyly, dvojcatá, stres (environmentálny, nutricný, vyvolaný chorobou); nepravidelnosti embrya alebo plodu, vplyv otca (paternita), imunogénne faktory. Boli identifikované tiež iatrogénne príciny EM a VFM. Zistili sa rozdiely v percente EM pri porovnávaní subfertilných kobýl s plodnými- fertilnými. Subfertilné kobyly sú definované ako kobyly ktoré mali opakovanú EM alebo FM, majú patologický kultivacný nález, alebo patologický nález pri biopsii; alebo sú jalové. Subfertilné kobyly majú podobné percento koncepcie na den 2 (ked boli embryá vyplavené z vajcovodu) ako kobyly fertilné. Percento žrebnosti v oboch skupinách kobýl avšak na den 14 (rozdielny cyklus) je však významne odlišné voci percentu embryonálnych vezikúl (vyššie u fertilných v porovnaní zo subfertilnými). Percento koncepcie na den 4 je tiež nižšie u starších subfertilných kobýl v porovnaní so zdravými kobylami. Prežívanie embryí prenesených do zdravých recipientiek bolo nižšie u subfertilnej skupiny než u zdravej. Na den 2 sa embryá zo zdravých a starších subfertilných kobýl kultivovali s oviduktálnymi bunkami z oboch skupín kobýl. Pri kultivovaní bud v zdravých alebo subfertilných oviduktálnych bunkových kultúrach boli embryá zo subfertilných kobýl horšej kvality než embryá zo zdravých kobýl...