Po voľbách v roku 1998 sa začal proces nápravy deformovaných cien energie, ktorý bol nezodpovedne prerušený v roku 1993 s dôsledkami najmä v sektore elektroenergetiky a zásobovania teplom, kde vláda neriešila ceny energie systematicky a tak boli, na rozdiel od Českej republiky, Poľska, Maďarska, ale aj Rumunska, ceny pre obyvateľov SR hlboko pod výrobnými nákladmi a boli jednou z príčin ťažkostí v energetike. Zdravý vývoj cien všetkých druhov energie pre podnikateľskú sféru aj pre obyvateľstvo je jedným z kľúčových momentov nielen pre transformáciu energetiky, ale aj pre urýchlenie štrukturálnych reforiem, nevyhnutných pre vybudovanie efektívneho trhového mechanizmu, s cieľom znížiť vysokú energetickú náročnosť hospodárstva SR. Deformované ceny energie negatívne ovplyvňovali podnikateľské prostredie v SR, pretože boli netransparentné, dávali falošné signály pre výrobcov, dodávateľov aj spotrebiteľov energie, ťažko sa robili správne investičné rozhodnutia. Základom ozdravenia energetického sektora a deformovaných cien energie a tepla bolo odstrániť všetky druhy dotácií k cenám energie a stanoviť cenu energie tak, aby každý odberateľ hradil náklady, ktoré svojim odberom vyvoláva.