Odpad zo zdravotníckych zariadení v niektorých krajinách môže byť aj príčinou infekcií. Týka sa to hlavne vírusov AIDS a hepatitídy. Z hľadiska prevencie nebezpečia šírenia infekcií a ochrany životného prostredia je od samého začiatku nevyhnutné oddeľovať infekčnú a farmaceutickú zložku odpadu od odpadu iných typov. Iné typy (ako napr. kvety, obalové materiály, jedlo) v podstate predstavujú obdobu domového odpadu.
Pri jeho zbere je nevyhnutné uplatniť zvláštne postupy.
Zneškodnenie ostrých predmetov, musí zostať prioritou.