Vnútroorganizačné-nákladové účtovníctvo je organizované spravidla formou analytických účtov, pričom sa už nezachováva povinnosť podvojného zápisu. V tejto oblasti účtovníctva sa bezprostredne odráža naturálna stránka priebehu hospodárskeho procesu, ktorú je nezriedka potrebné vyjadriť aj v naturálnych jednotkách. Zobrazenie priebehu hospodárskeho procesu z hľadiska potrieb vnútropodnikovej štruktúry a vyrábaných výkonov a potreba jeho kontroly vyvoláva nevyhnutnosť väzby vnútroorganizačného účtovníctva s predbežnou a výslednou kalkuláciou a s rozpočtami príslušných vnútropodnikových útvarov. Vnútroorganizačné účtovníctvo, použité oceňovanie v ňom a odpisovanie je vnútornou záležitosťou podniku (manažmentu).